Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFDP3Q5H9I0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms