Protein–RNA interactions for Protein: Q5EB52

MEST, Mesoderm-specific transcript homolog protein, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTQ5EB52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESTQ5EB52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESTQ5EB52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESTQ5EB52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms