Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLE1Q53GS7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLE1Q53GS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLE1Q53GS7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms