Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIT3Q3SXY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIT3Q3SXY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIT3Q3SXY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms