Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VWC2Q2TAL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms