Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICBQ29980 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICBQ29980 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICBQ29980 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICBQ29980 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICBQ29980 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICBQ29980 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MICBQ29980 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICBQ29980 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICBQ29980 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICBQ29980 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICBQ29980 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MICBQ29980 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICBQ29980 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICBQ29980 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICBQ29980 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICBQ29980 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICBQ29980 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICBQ29980 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICBQ29980 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICBQ29980 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MICBQ29980 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MICBQ29980 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICBQ29980 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICBQ29980 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICBQ29980 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICBQ29980 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICBQ29980 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms