Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHQ16836 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHQ16836 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHQ16836 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHQ16836 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHQ16836 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHQ16836 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHQ16836 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHQ16836 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHQ16836 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHQ16836 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHQ16836 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHQ16836 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHQ16836 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHQ16836 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHQ16836 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHQ16836 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHQ16836 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHQ16836 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHQ16836 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHQ16836 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHQ16836 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHQ16836 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHQ16836 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHQ16836 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHQ16836 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHQ16836 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHQ16836 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHQ16836 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHQ16836 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHQ16836 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHQ16836 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHQ16836 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HADHQ16836 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HADHQ16836 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HADHQ16836 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HADHQ16836 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHQ16836 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHQ16836 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHQ16836 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHQ16836 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHQ16836 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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