Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R3AQ16821 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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