Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA9Q16790 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA9Q16790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA9Q16790 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CA9Q16790 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CA9Q16790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA9Q16790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CA9Q16790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA9Q16790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA9Q16790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA9Q16790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA9Q16790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA9Q16790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CA9Q16790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA9Q16790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA9Q16790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA9Q16790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA9Q16790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA9Q16790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA9Q16790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA9Q16790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA9Q16790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA9Q16790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA9Q16790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA9Q16790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA9Q16790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA9Q16790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA9Q16790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA9Q16790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA9Q16790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA9Q16790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA9Q16790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA9Q16790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CA9Q16790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA9Q16790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA9Q16790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CA9Q16790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA9Q16790 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CA9Q16790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA9Q16790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA9Q16790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CA9Q16790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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