Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC1Q16533 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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