Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDB1Q16531 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDB1Q16531 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDB1Q16531 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
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