Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USF2Q15853 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USF2Q15853 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USF2Q15853 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USF2Q15853 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USF2Q15853 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USF2Q15853 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USF2Q15853 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USF2Q15853 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USF2Q15853 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USF2Q15853 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USF2Q15853 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USF2Q15853 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USF2Q15853 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USF2Q15853 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USF2Q15853 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USF2Q15853 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USF2Q15853 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
USF2Q15853 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USF2Q15853 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USF2Q15853 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USF2Q15853 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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