Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC1Q15751 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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