Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF11Q15544 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF11Q15544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF11Q15544 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms