Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SURF2Q15527 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SURF2Q15527 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms