Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC23AQ15436 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC23AQ15436 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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