Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CNN3Q15417 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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