Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB35Q15286 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB35Q15286 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB35Q15286 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB35Q15286 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB35Q15286 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB35Q15286 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB35Q15286 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB35Q15286 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB35Q15286 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB35Q15286 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB35Q15286 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RAB35Q15286 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB35Q15286 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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