Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHPRHQ149N8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHPRHQ149N8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHPRHQ149N8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
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