Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSPNQ14714 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSPNQ14714 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSPNQ14714 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms