Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBR1Q14596 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBR1Q14596 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBR1Q14596 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms