Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM29Q14134 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM29Q14134 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM29Q14134 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM29Q14134 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM29Q14134 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM29Q14134 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM29Q14134 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM29Q14134 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms