Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC1Q13547 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC1Q13547 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
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