Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQSTM1Q13501 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQSTM1Q13501 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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