Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED1Q13445 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMED1Q13445 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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