Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC4Q13426 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
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