Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTGDRQ13258 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGDRQ13258 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGDRQ13258 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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