Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTP4A2Q12974 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTP4A2Q12974 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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