Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4Q12950 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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