Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SFSWAPQ12872 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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