Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF5AQ12840 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF5AQ12840 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF5AQ12840 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF5AQ12840 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF5AQ12840 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF5AQ12840 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF5AQ12840 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF5AQ12840 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms