Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPTFQ12830 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPTFQ12830 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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