Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO1Q12778 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms