Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC173Q0VFZ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms