Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCBP1Q09161 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCBP1Q09161 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms