Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4CQ08493 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4CQ08493 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms