Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXM1Q08050 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXM1Q08050 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms