Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBQ06643 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBQ06643 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBQ06643 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBQ06643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBQ06643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBQ06643 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBQ06643 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBQ06643 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBQ06643 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBQ06643 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBQ06643 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBQ06643 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBQ06643 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBQ06643 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBQ06643 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBQ06643 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBQ06643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms