Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB3Q05901 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms