Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.9 ms