Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBE1Q04446 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBE1Q04446 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms