Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLH2Q02577 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.2 ms