Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLCB3Q01970 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLCB3Q01970 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms