Protein–RNA interactions for Protein: Q01477

UBP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP3Q01477 MPS2YGL075C 1164 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 HMS2YJR147W 1077 nt7.31□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 LDB7YBL006C 543 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 RPL31BYLR406C 342 nt7.31□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 SNT309YPR101W 528 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 AMN1YBR158W 1650 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 ICP55YER078C 1536 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 MUM3YOR298W 1440 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 AGX1YFL030W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 YGL102CYGL102C 429 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 ISY1YJR050W 708 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 SPG5YMR191W 1122 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 YPR076WYPR076W 375 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 MSC3YLR219W 2187 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 TRS31YDR472W 852 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 VAR1Q0140 1197 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 GTO1YGR154C 1071 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 AAD14YNL331C 1131 nt7.29□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 PLB3YOL011W 2061 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 IRS4YKR019C 1848 nt7.29□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 ECM30YLR436C 3825 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 NUP49YGL172W 1419 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 VBA5YKR105C 1749 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 MRPL28YDR462W 444 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 CBR1YIL043C 855 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 PRI1YIR008C 1230 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 AIM2YAL049C 741 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 FES1YBR101C 873 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 ARH1YDR376W 1482 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 HHY1YEL059W 309 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SPC42YKL042W 1092 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 DBR1YKL149C 1218 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 NMD4YLR363C 657 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SEC62YPL094C 825 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SMX3YPR182W 261 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 TUF1YOR187W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SRP101YDR292C 1866 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 RTT103YDR289C 1230 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 NEJ1YLR265C 1029 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 PMT2YAL023C 2280 nt7.26□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 ERS1YCR075C 783 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 PPH21YDL134C 1110 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 AIR1YIL079C 1083 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 MRPL25YGR076C 474 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 MTR3YGR158C 753 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SPO12YHR152W 522 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 YLL056CYLL056C 897 nt7.24□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 MEU1YLR017W 1014 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 ASR1YPR093C 867 nt7.24□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 ADH5YBR145W 1056 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 DAL4YIR028W 1908 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 YDR132CYDR132C 1488 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 COX15YER141W 1461 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 CDC34YDR054C 888 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 PAC10YGR078C 600 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 YET2YMR040W 483 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 PEX27YOR193W 1131 nt7.23□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 MCH2YKL221W 1422 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 PAC2YER007W 1557 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 GPH1YPR160W 2709 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SLA2YNL243W 2907 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 MMR1YLR190W 1476 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 CCT3YJL014W 1605 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SIT1YEL065W 1887 nt7.22□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 EDC1YGL222C 528 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 HOC1YJR075W 1191 nt7.22□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 MSA2YKR077W 1092 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 REX3YLR107W 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 FMP40YPL222W 2067 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 SEC18YBR080C 2277 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 RGD2YFL047W 2145 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP3Q01477 CRH1YGR189C 1524 nt7.22□□□□□ -1.25 RIP-Chip
UBP3Q01477 RAM1YDL090C 1296 nt7.21□□□□□ -1.26 RIP-Chip
UBP3Q01477 YGL235WYGL235W 537 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 PEX22YAL055W 543 nt7.21□□□□□ -1.26 RIP-Chip
UBP3Q01477 TSR2YLR435W 618 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 YML131WYML131W 1098 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 ARC35YNR035C 1029 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 ARR1YPR199C 885 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 SRF1YDL133W 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 DOT1YDR440W 1749 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 IVY1YDR229W 1362 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 RPL2BYIL018W 765 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 MAD2YJL030W 591 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 CLD1YGR110W 1338 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 EMP65YER140W 1671 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 YBR241CYBR241C 1467 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 GSH1YJL101C 2037 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 CYS4YGR155W 1524 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 PCL6YER059W 1263 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 KRE9YJL174W 831 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 YKL077WYKL077W 1179 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 OMA1YKR087C 1038 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 YBR027CYBR027C 333 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 HBN1YCL026C-B 582 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 WTM1YOR230W 1314 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP3Q01477 MIP1YOR330C 3765 nt7.19□□□□□ -1.26 RIP-Chip
UBP3Q01477 FCY22YER060W-A 1593 nt7.18□□□□□ -1.26
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