Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX1Q01196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms