Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK17Q00537 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK17Q00537 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms