Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX1P83916 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX1P83916 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX1P83916 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX1P83916 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX1P83916 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX1P83916 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX1P83916 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX1P83916 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX1P83916 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX1P83916 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX1P83916 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX1P83916 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX1P83916 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CBX1P83916 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX1P83916 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX1P83916 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX1P83916 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX1P83916 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX1P83916 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX1P83916 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX1P83916 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX1P83916 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX1P83916 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX1P83916 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX1P83916 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX1P83916 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX1P83916 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX1P83916 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX1P83916 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX1P83916 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX1P83916 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX1P83916 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX1P83916 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX1P83916 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX1P83916 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX1P83916 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX1P83916 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX1P83916 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX1P83916 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX1P83916 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX1P83916 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms