Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL11P62913 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL11P62913 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL11P62913 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL11P62913 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL11P62913 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL11P62913 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL11P62913 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL11P62913 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL11P62913 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL11P62913 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL11P62913 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL11P62913 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL11P62913 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL11P62913 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL11P62913 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL11P62913 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL11P62913 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL11P62913 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL11P62913 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL11P62913 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms