Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4XP62701 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4XP62701 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS4XP62701 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms