Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRPFP62306 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPFP62306 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPFP62306 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms